W V LO im. Kanclerza Jana Zamoyskiego młodzież uczy się wielu przedmiotów w sposób innowacyjny. Wprowadzone co roku innowacje pedagogiczne, które w znacznym stopniu wpływają na jakość kształcenia w szkole. Każda innowacja realizowana jest w trzyletnim cyklu nauki.

W roku szkolnym 2009/2010 wprowadzono innowację pedagogiczną: „Poznawanie dziedzictwa kulturowego Europy na lekcjach języków obcych metodą projektu w korelacji z programem Comeniusa”, która będzie realizowana do czerwca 2012 r. W ramach tej innowacji uczniowie samodzielnie zdobywają informacje, przygotowują opracowania oraz prezentują swoje projekty dotyczące muzyki krajów europejskich, literatury i teatru oraz europejskich muzeów. Ponadto rozwijają one umiejętności formułowania problemu, wykorzystywania różnych źródeł informacji oraz oceniania ich wiarygodności, a także przygotowania i praktykowania wystąpień publicznych  i współpracy z innymi w grupie.
Realizacja tej innowacji ukierunkowana jest na kształcenie świadomości tolerancji uczniów w szeroko pojętym aspekcie kulturowym. Uczniowie mają możliwość autonomicznego dochodzenia do faktów oraz obalania mitów o narodach, ich kulturze, obyczajowości i ich językach, porównując z rodzimą kulturą. Uczniowie, tym samym uczą się tolerancji dla odmienności, przez co kształtują świadomość europejską. A uwagi na fakt przygotowania projektów w językach obcych (angielski, niemiecki, francuski, włoski, hiszpański) uczniowie podnoszą swoje kompetencje językowe oraz świadomość językową.

W roku szkolnym 2010/2011 została wprowadzona innowacja pedagogiczna: „Wykorzystanie blended learningu na lekcjach języka angielskiego, wiedzy o społeczeństwie, geografii i matematyki realizowanych na poziomie rozszerzonym”.

Będzie ona realizowana do czerwca 2013 r. Innowacja ta polega na zastosowaniu nauczania komplementarnego, czyli proporcjonalnego do założonych celów dydaktycznych połączenia kształcenia tradycyjnego ze zdalnym, czyli wykorzystując środki techniczne ( Internet).
Innowacja polega na skolerowaniu pracy z wykorzystaniem komputera i Internetu oraz regularnych spotkań z nauczycielem. Wykorzystanie komputera nadaje nauce tempa, stymuluje ją, a tradycyjne metody nauczania nie pozbawiają ucznia kontaktu z grupą i nauczycielem.

W roku szkolnym 2011/2012 wdrożono innowację pedagogiczną: „Konektywizm jako nowoczesna metoda nauczania w epoce cyfrowej realizowana na lekcjach języka angielskiego, języka francuskiego, biologii i matematyki na poziomie rozszerzonym” i będzie realizowana do czerwca 2014 r.

Podstawową tezą kolektywizmu jest założenie, że ludzka wiedza nie musi być cała w głowie oraz, że człowiek podejmuje decyzje na podstawie określonego zasobu informacji, który nieustannie zmienia się. A więc uczeń musi „wiedzieć gdzie” (know-where) poszukiwać zasobu wiedzy i jak rozróżniać, co jest istotne, a co nie. Na lekcjach uczeń stosujący metodę kolektywizmu będzie odnajdywał wiedzę, gromadził ją w urządzeniach, przetwarzał łączył i przekazywał. Będzie także przeglądał atrakcyjne dla siebie informacje, przenosił treści do swoich plików, modyfikował je, redagował nowe teksty, a także konsultował je z innymi, zbierał opinie i recenzje efektów własnej pracy. Nauczyciel będzie pełnił rolę doradczą i organizacyjną.
Głównym zadaniem tej innowacji będzie wykazanie się umiejętnością pozyskiwania wiedzy, a nie wiedza sama w sobie. Uczniowie będą niejako zmuszani do wykorzystania swoje zaradności, przedsiębiorczości, inteligencji oraz umiejętności szybkiego i poprawnego znalezienia danej informacji. Ponadto metoda ta przygotuje ucznia do interesującego prezentowania swojej wiedzy, krytycznego myślenia, spostrzegania danych informacji oraz dokonywania samooceny swoich przedmiotowych osiągnięć szkolnych.

W roku szkolnym 2012/2013 planowane jest wdrożenie innowacji pedagogicznej „Nauka języka angielskiego, niemieckiego, hiszpańskiego, włoskiego, francuskiego oraz geografii i historii przy zastosowaniu metody Web Quest, wykorzystującej Internet jako narzędzie wspomagające tradycyjny proces nauczania”.

Jest to metoda nauczania nakierowana na wyszukiwanie, w której większość lub całość informacji pozyskiwana jest w sposób interaktywny i pochodzi z zasobów internetowych, opcjonalnie uzupełniana jest telekonferencjami i materiałami podręcznymi. Stworzył ją w roku 1995 Bernie Dodge – Profesor Uniwersity of Eductional Technology z San Diego w oparciu o założenia konstruktywizmu. Konstruktywizm pedagogiczny jest teorią uczenia się, poznawania i zdobywania wiedzy. Konstruktywizm zakłada, że uczeń jest samodzielnym i aktywnym podmiotem, który korzystając z różnych źródeł informacji konstruuje swój własny system wiedzy i swoją osobowość. Uczący się sami tworzą wiedzę, która w nich rezyduje i dlatego wiedza osobista ma charakter tak indywidualny, jak różne są osobowości uczących się.